Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO4P98177 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms