Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms