Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSNK2A1P68400 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms