Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2L3P68036 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2L3P68036 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2L3P68036 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2L3P68036 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2L3P68036 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2L3P68036 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2L3P68036 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms