Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERV-K104P61576 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms