Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms