Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A1P60842 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms