Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms