Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms