Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP6P55212 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP6P55212 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP6P55212 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP6P55212 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms