Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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