Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms