Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms