Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms