Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME1P48163 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME1P48163 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME1P48163 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms