Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHKA1P46020 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms