Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP5P45974 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP5P45974 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP5P45974 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP5P45974 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP5P45974 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP5P45974 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP5P45974 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms