Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms