Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD200P41217 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD200P41217 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD200P41217 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD200P41217 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms