Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms