Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms