Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms