Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA10P31260 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms