Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXD3P31249 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD3P31249 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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