Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRABP1P29762 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms