Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms