Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRMP28827 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRMP28827 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
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