Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms