Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms