Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms