Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTX3P26022 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTX3P26022 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTX3P26022 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms