Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSSP25774 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms