Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKCHP24723 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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