Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PVALBP20472 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PVALBP20472 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PVALBP20472 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PVALBP20472 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PVALBP20472 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PVALBP20472 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms