Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM21P19474 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM21P19474 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM21P19474 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms