Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF3P18847 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF3P18847 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF3P18847 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms