Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DESP17661 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DESP17661 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DESP17661 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DESP17661 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DESP17661 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DESP17661 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DESP17661 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DESP17661 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DESP17661 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms