Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MUC1P15941 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MUC1P15941 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MUC1P15941 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms