Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSPP15924 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSPP15924 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSPP15924 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSPP15924 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms