Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFTRP13569 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFTRP13569 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFTRP13569 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFTRP13569 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms