Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLBP1P12271 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms