Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms