Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD28P10747 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD28P10747 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD28P10747 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms