Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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