Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms