Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
VIL1P09327 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIL1P09327 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms