Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP10P09238 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP10P09238 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP10P09238 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP10P09238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms