Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLK3P07288 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLK3P07288 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms