Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCNP04198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCNP04198 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms