Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNB1P01574 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms